叶丹研究员

 

    叶丹,博士,青年PI,研究员,博士生导师。上海市启明星,复旦大学三八红旗手。
    2002年毕业于浙江大学获理学学士学位,2005年毕业于浙江大学获遗传学硕士学位,2008年毕业于荷兰莱顿大学(Leiden University)获生物制药博士学位,2008-2010年在莱顿大学阿姆斯特丹/莱顿药物研发中心做博士后,从事脂类代谢和心血管疾病发病机理方面的研究。2011年初受聘复旦大学生物医学研究院青年PI,全职回国工作,围绕”代谢与人类疾病”,开展”乙酰化调控代谢酶分子机制”和”代谢中间物参与表观遗传调控分子机制”两方面研究,取得了一系列原创性科研成果。
迄今,在Cancer Cell, Genes&Development, Cell Metabolism, Molecular Cell, Cell Research, EMBO J, Oncogene,Circulation Research等国际核心期刊共发表SCI论文30篇,其中第一作者或共同通讯作者论文14篇。承担“2011年度国家重点基础研究发展计划项目”课题一项(课题组长),国家自然科学基金面上项目一项(主持),参与国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目一项,获上海市科委人才计划青年启明星计划A类(主持)、上海市教委科研创新重点项目资助(主持)、复旦大学卓学计划(主持)。

 

主要研究方向:
肿瘤代谢,代谢中间物参与表观遗传调控分子机制。

 

代表性论文(*通讯作者)
1. Ma,S-H. , Jiang,B-W., Deng,W-L., Gu,Z-K., Wu,F-Z.,  Li,T-T., Xia,Y-K., Yang,H., Ye,D.,* Xiong, Y.,* and Guan, K-L.*. D-2-Hydroxyglutarate is essential for maintaining oncogenic property of mutant IDH-containing cancer cells but dispensable for cell growth. Oncotarget. 2015. In press.
2. Hui Yang, Lisha Zhou, Qian Shi, Yuzheng Zhao, Huaipeng Lin, Mengli Zhang, Yi Yang, Zhi-Qiang Ling, Kun-Liang Guan*, Yue Xiong*, and Dan Ye*. SIRT3-dependent GOT2 acetylation enhances the malate-aspartate NADH shuttle activity to promote pancreatic tumor growth. EMBO J. 2015. In press.
3. Wang Y-P, Xiao M-T, Chen X-F, Chen L-L, Xu Y-P, Lv L, Wang P, Yang H, Ma S-H, Lin H-P, Jiao B, Ren R-B, Ye D*, Guan, K-L*, and Xiong Y*. WT1 recruits TET2 to regulate its target gene expression and suppress leukemia cell proliferation. Mol Cell. 2015; 57(4):662-73.
4. Wang YP, Zhou LS, Zhao YZ, Wang SW, Chen LL, Liu LX, Ling ZQ, Hu FJ, Sun YP, Zhang JY, Yang C, Yang Y, Xiong Y, Guan KL, Ye D*. Regulation of G6PD acetylation by KAT9/SIRT2 modulates NADPH homeostasis and cell survival during oxidative stress.  EMBO J. 2014; 33(12):1304-20.
5. Yang H. Lin H-P, Xu H-Y, Zhang L, Cheng L, Wen B, Shou J-Y, Guan K-L, Xiong Y, Ye D*. TET-catalyzed 5-methylcytosine hydroxylation is dynamically regulated by metabolites. Cell Research. 2014; 24(8):1017-20.
 6. Yang H, Liu Y, Bai F, Zhang J-Y, Ma S-H, Liu J, Xu Z-D, Zhu H-G, Ling Z-Q, Ye D*, Guan K-L* and Xiong Y*. Tumor development is associated with decrease of TET gene expression and 5-methylcytosine hydroxylation. Oncogene. 2013; 32(5):663-9.
7. Ye D, Ma S-H, XiongY , GuanK-L*. R-2-Hydroxyglutarate as the Key Effector of IDH Mutations Promoting Oncogenesis. Cancer Cell. 2013; 23(3):274-276.
8. Wang P, Dong QZ, Zhang C, Kuan PF, Liu YF, Jeck WR, Jiang WQ, Savich GL, Tan TX, Andersen JB, J Auman JY, Hoskins JM, Misher AD, Moser CD, Yourstone SM, Kim JW, Cibulskis K, Getz G, Hunt HV, Thorgeirsson SS, Roberts LR, Ye D, Guan K-L, Xiong Y, Qin L-X*, Chiang DY*. Mutations in Isocitrate Dehydrogenase 1 and 2 are Associated with DNA Hypermethylation in Intrahepatic Cholangiocarcinomas. Oncogene. 2013; 32(25):3091-100.
9. Ye D*, Guan K-L* and Xiong Y*. The mechanisms of IDH mutations in tumorigenesis. Cell Research. 2012; 22 (7):1102-4.
10. Xiao M, Yang H, Xu W, Ma S, Lin H, Zhu H, Liu L, Liu Y, Yang C, Xu Y, Zhao S, Ye D*, Xiong Y*, Guan KL. Inhibition of α-KG-dependent histone and DNA demethylases by fumarate and succinate that are accumulated in mutations of FH and SDH tumor suppressors. Genes & Development. 2012; 26(12):1326-1338.

 

主要承担课题
课题负责人在研的科研项目
课题来源               课题编号               
国家科技部              2012CB910303 (国家重点基础研究发展计划项目)
国家自然科学基金    8137219  (面上项目)
国家自然科学基金 81120108016 (国际(地区)合作与交流项目)
上海市科委            14QA1400600(人才计划青年启明星计划A类)
上海市教委           12ZZ008 (科研创新重点项目)

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