刘贇 研究员

 

    刘贇,研究员,博士生导师。2003年获复旦大学生命科学学院学士学位,同年赴美国约翰霍普金斯大学医学院攻读博士学位。2009年获美国约翰霍普金斯大学公共卫生学院生物统计学硕士和美国约翰霍普金斯大学医学院分子生物与遗传学博士双学位。2009至2014年在美国约翰霍普金斯大学表观遗传中心做博士后研究。2014年入选中组部第五批“青年千人计划”,并受聘于复旦大学基础医学院生物化学与分子生物学系,任研究员。
    刘贇实验室主要运用表观遗传组学的方法,研究人类癌症以及复杂疾病,如类风湿性关节炎、肥胖等的成因及致病的生化机理机制。学术成果被发表在Immunity、Nature Genetics、Nature Biotechnology、The American Journal of Human Genetics等国际第一流的学术科研期刊上。在过去5年中,论文被引用600多次,所作出的学术成果受到包括纽约时报在内的多家主要媒体的广泛报道。
    目前负责国家自然科学基金面上项目1项并参与了1项国家973课题。

 

主要研究方向:
1.表观遗传修饰在癌症及复杂疾病中的调控
2.DNA甲基化致病的生化机理机制

 

代表性论文(#为并列第一作者)
1.Lu C, Ward A, Bettridge J, Liu Y, Desiderio S., An Autoregulatory Mechanism Imposes Allosteric Control on the V(D)J Recombinase by Histone H3 Methylation. Cell Rep. 10:1-10, 2015
2.Liu Y#, Li X#, Aryee MJ, Ekstrom TJ, Padyukov L, Klareskog L, Vandiver A, Moore AZ, Tanaka T, Ferrucci L, Fallin MD, Feinberg AP. GeMes: Clusters of DNA methylation under genetic control can inform genetic and epigenetic analysis of disease. Am. J. Hum. Genet. 94:485-495, 2014
3.Liu Y#, Aryee MJ#, Padyukov L#, Fallin MD#, Hesselberg E, Runarsson A, Reinius L, Acevedo N, Taub M, Ronninger M, Shchetynsky K, Scheynius A, Kere J, AlfredssonL, Klareskog L, Ekstrom TJ, Feinberg AP. Epigenome-wide association data implicate DNA methylation as an intermediary of generic risk in Rheumatoid Arthritis. Nat. Biotechnol. 31:142-147, 2013
4.Hansen KD, Timp W, Bravo HC, Sabunciyan S, Langmead B, McDonald OG, Wen B, Wu H, Liu Y, Diep D, Briem E, Zhang K, Irizarry RA, Feinberg AP. Increased Methylation Variation in Epigenetic Domains Across Cancer Types. Nat. Genetics. 43:768-775, 2011  
5.Liu Y, Subrahmanyam R, Chakraborty T, Sen R, Desiderio S. A Plant Homeodomain in RAG-2 that Binds Hypermethylated Lysine 4 of Histone H3 is Necessary For Efficient Antigen-Receptor-Gene Rearrangement. Immunity. 27:561-571, 2007 (Cover Story)

 

主要承担课题
课题负责人在研的科研项目
课题来源               课题编号               
国家自然科学基金    31471212  (面上项目)

 

代表性著作
Liu Y, Zhang L, Desiderio S. Temporal and Spatial Regulation of V(D)J Recombination Interactions of Extrinsic Factors with the RAG Complex. V(D)J Recombination (Landes Bioscience, ISBN-13: 978- 1441902955) 2009.

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