复旦大学代谢分子医学教育部重点实验室，在原复旦大学上海医学院分子遗传学教研室的基础上组建。分子遗传学教研室成立于1988年，随后不断发展壮大，2001年以“分子遗传学教研室”为基础申报成立“分子医学教育部重点实验室”，经教育部立项，2002年评估后正式成立。 经过十余年的发展，重点实验室在不断地整合和凝练中，通过全面了解国内外对代谢性疾病的认识程度及存在问题，结合重点实验室的科研优势及条件，参考学术委员会的建议，实验室于2013年初提出将“分子医学教育部重点实验室”更名为“代谢分子医学教育部重点实验室”的请示，于2014年1月获教育部批准。

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